Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD55P08174 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD55P08174 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD55P08174 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD55P08174 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD55P08174 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD55P08174 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD55P08174 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CD55P08174 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD55P08174 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD55P08174 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD55P08174 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD55P08174 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD55P08174 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD55P08174 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD55P08174 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD55P08174 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD55P08174 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD55P08174 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD55P08174 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD55P08174 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD55P08174 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD55P08174 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD55P08174 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD55P08174 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD55P08174 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD55P08174 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD55P08174 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD55P08174 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD55P08174 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD55P08174 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD55P08174 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD55P08174 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD55P08174 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD55P08174 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD55P08174 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD55P08174 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD55P08174 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD55P08174 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD55P08174 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD55P08174 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD55P08174 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD55P08174 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD55P08174 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD55P08174 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD55P08174 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD55P08174 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD55P08174 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD55P08174 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD55P08174 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD55P08174 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD55P08174 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CD55P08174 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD55P08174 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD55P08174 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD55P08174 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD55P08174 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD55P08174 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD55P08174 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD55P08174 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD55P08174 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD55P08174 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD55P08174 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD55P08174 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD55P08174 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD55P08174 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD55P08174 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD55P08174 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD55P08174 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD55P08174 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD55P08174 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD55P08174 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD55P08174 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD55P08174 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD55P08174 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD55P08174 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD55P08174 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD55P08174 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD55P08174 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD55P08174 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD55P08174 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD55P08174 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD55P08174 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD55P08174 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD55P08174 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD55P08174 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD55P08174 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD55P08174 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD55P08174 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD55P08174 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD55P08174 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD55P08174 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD55P08174 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD55P08174 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD55P08174 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD55P08174 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD55P08174 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD55P08174 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD55P08174 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD55P08174 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms