Protein–RNA interactions for Protein: P08172

CHRM2, Muscarinic acetylcholine receptor M2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM2P08172 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM2P08172 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRM2P08172 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRM2P08172 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRM2P08172 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRM2P08172 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRM2P08172 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRM2P08172 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHRM2P08172 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRM2P08172 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms