Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN1P07384 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN1P07384 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN1P07384 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN1P07384 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN1P07384 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CAPN1P07384 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPN1P07384 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN1P07384 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN1P07384 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN1P07384 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN1P07384 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN1P07384 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN1P07384 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN1P07384 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPN1P07384 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPN1P07384 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN1P07384 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN1P07384 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN1P07384 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN1P07384 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN1P07384 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPN1P07384 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN1P07384 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN1P07384 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN1P07384 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN1P07384 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN1P07384 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN1P07384 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN1P07384 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN1P07384 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN1P07384 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN1P07384 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN1P07384 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN1P07384 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN1P07384 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN1P07384 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms