Protein–RNA interactions for Protein: P05787

KRT8, Keratin, type II cytoskeletal 8, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8P05787 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT8P05787 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT8P05787 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT8P05787 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT8P05787 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT8P05787 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT8P05787 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT8P05787 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT8P05787 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT8P05787 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT8P05787 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT8P05787 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT8P05787 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT8P05787 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT8P05787 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT8P05787 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT8P05787 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT8P05787 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT8P05787 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT8P05787 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT8P05787 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT8P05787 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT8P05787 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT8P05787 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT8P05787 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT8P05787 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT8P05787 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT8P05787 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT8P05787 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT8P05787 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT8P05787 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT8P05787 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT8P05787 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT8P05787 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT8P05787 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT8P05787 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT8P05787 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT8P05787 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT8P05787 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT8P05787 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT8P05787 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT8P05787 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT8P05787 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT8P05787 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT8P05787 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT8P05787 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT8P05787 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT8P05787 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT8P05787 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT8P05787 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT8P05787 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT8P05787 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT8P05787 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT8P05787 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT8P05787 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT8P05787 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT8P05787 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT8P05787 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT8P05787 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT8P05787 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT8P05787 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT8P05787 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT8P05787 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT8P05787 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT8P05787 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT8P05787 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT8P05787 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT8P05787 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT8P05787 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT8P05787 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT8P05787 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT8P05787 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT8P05787 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT8P05787 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT8P05787 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT8P05787 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT8P05787 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT8P05787 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT8P05787 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT8P05787 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT8P05787 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT8P05787 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT8P05787 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT8P05787 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT8P05787 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT8P05787 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT8P05787 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT8P05787 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT8P05787 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT8P05787 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT8P05787 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT8P05787 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT8P05787 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT8P05787 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT8P05787 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT8P05787 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT8P05787 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT8P05787 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT8P05787 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT8P05787 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms