Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB2P05107 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB2P05107 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB2P05107 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB2P05107 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB2P05107 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB2P05107 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB2P05107 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB2P05107 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB2P05107 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB2P05107 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB2P05107 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB2P05107 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB2P05107 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB2P05107 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB2P05107 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGB2P05107 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB2P05107 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB2P05107 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB2P05107 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB2P05107 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB2P05107 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB2P05107 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB2P05107 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms