Protein–RNA interactions for Protein: P04637

TP53, Cellular tumor antigen p53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53P04637 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TP53P04637 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TP53P04637 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TP53P04637 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TP53P04637 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TP53P04637 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TP53P04637 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TP53P04637 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TP53P04637 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TP53P04637 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TP53P04637 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TP53P04637 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TP53P04637 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TP53P04637 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TP53P04637 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TP53P04637 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TP53P04637 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TP53P04637 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TP53P04637 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TP53P04637 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TP53P04637 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TP53P04637 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TP53P04637 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TP53P04637 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TP53P04637 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TP53P04637 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TP53P04637 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TP53P04637 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TP53P04637 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP53P04637 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP53P04637 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TP53P04637 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TP53P04637 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TP53P04637 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TP53P04637 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TP53P04637 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP53P04637 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53P04637 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53P04637 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP53P04637 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53P04637 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53P04637 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53P04637 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53P04637 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP53P04637 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP53P04637 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TP53P04637 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TP53P04637 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP53P04637 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP53P04637 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP53P04637 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53P04637 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53P04637 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TP53P04637 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP53P04637 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP53P04637 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP53P04637 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TP53P04637 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TP53P04637 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TP53P04637 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TP53P04637 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TP53P04637 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TP53P04637 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53P04637 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TP53P04637 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TP53P04637 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TP53P04637 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TP53P04637 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TP53P04637 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TP53P04637 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TP53P04637 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TP53P04637 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TP53P04637 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TP53P04637 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TP53P04637 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TP53P04637 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TP53P04637 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53P04637 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TP53P04637 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53P04637 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TP53P04637 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53P04637 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TP53P04637 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TP53P04637 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TP53P04637 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TP53P04637 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TP53P04637 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TP53P04637 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TP53P04637 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TP53P04637 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53P04637 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TP53P04637 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TP53P04637 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TP53P04637 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53P04637 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53P04637 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TP53P04637 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TP53P04637 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TP53P04637 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TP53P04637 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms