Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P04436 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
P04436 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
P04436 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
P04436 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P04436 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
P04436 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04436 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P04436 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P04436 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P04436 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P04436 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
P04436 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P04436 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P04436 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P04436 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P04436 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
P04436 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
P04436 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P04436 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P04436 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
P04436 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
P04436 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
P04436 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
P04436 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P04436 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
P04436 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P04436 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P04436 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P04436 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P04436 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P04436 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
P04436 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P04436 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P04436 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P04436 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P04436 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P04436 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P04436 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P04436 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P04436 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P04436 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P04436 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P04436 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P04436 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P04436 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P04436 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P04436 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
P04436 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P04436 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P04436 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
P04436 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P04436 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P04436 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P04436 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P04436 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P04436 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
P04436 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P04436 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P04436 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P04436 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P04436 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P04436 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P04436 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P04436 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P04436 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
P04436 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
P04436 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P04436 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P04436 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P04436 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P04436 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P04436 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P04436 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P04436 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P04436 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P04436 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P04436 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P04436 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P04436 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
P04436 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P04436 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P04436 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P04436 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P04436 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P04436 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P04436 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P04436 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P04436 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P04436 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P04436 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P04436 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P04436 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P04436 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P04436 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P04436 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P04436 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P04436 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P04436 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P04436 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms