Protein–RNA interactions for Protein: P02724

GYPA, Glycophorin-A, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPAP02724 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GYPAP02724 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GYPAP02724 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYPAP02724 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYPAP02724 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYPAP02724 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPAP02724 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPAP02724 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPAP02724 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPAP02724 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYPAP02724 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYPAP02724 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYPAP02724 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYPAP02724 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPAP02724 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPAP02724 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPAP02724 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPAP02724 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPAP02724 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPAP02724 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPAP02724 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPAP02724 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPAP02724 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPAP02724 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPAP02724 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPAP02724 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPAP02724 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPAP02724 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPAP02724 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPAP02724 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPAP02724 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GYPAP02724 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GYPAP02724 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYPAP02724 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GYPAP02724 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GYPAP02724 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GYPAP02724 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYPAP02724 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYPAP02724 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYPAP02724 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GYPAP02724 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GYPAP02724 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GYPAP02724 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GYPAP02724 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GYPAP02724 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GYPAP02724 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GYPAP02724 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GYPAP02724 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GYPAP02724 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GYPAP02724 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GYPAP02724 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GYPAP02724 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GYPAP02724 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GYPAP02724 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GYPAP02724 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GYPAP02724 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GYPAP02724 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GYPAP02724 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GYPAP02724 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GYPAP02724 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYPAP02724 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GYPAP02724 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GYPAP02724 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYPAP02724 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GYPAP02724 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GYPAP02724 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYPAP02724 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GYPAP02724 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GYPAP02724 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYPAP02724 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GYPAP02724 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYPAP02724 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYPAP02724 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYPAP02724 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYPAP02724 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYPAP02724 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYPAP02724 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYPAP02724 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GYPAP02724 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYPAP02724 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYPAP02724 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYPAP02724 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYPAP02724 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GYPAP02724 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GYPAP02724 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GYPAP02724 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYPAP02724 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYPAP02724 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GYPAP02724 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GYPAP02724 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GYPAP02724 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYPAP02724 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYPAP02724 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYPAP02724 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYPAP02724 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GYPAP02724 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GYPAP02724 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYPAP02724 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GYPAP02724 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GYPAP02724 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms