Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD8AP01732 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD8AP01732 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD8AP01732 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD8AP01732 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD8AP01732 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8AP01732 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8AP01732 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD8AP01732 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD8AP01732 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8AP01732 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8AP01732 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD8AP01732 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD8AP01732 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD8AP01732 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD8AP01732 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD8AP01732 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD8AP01732 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD8AP01732 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD8AP01732 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD8AP01732 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD8AP01732 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8AP01732 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD8AP01732 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CD8AP01732 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD8AP01732 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8AP01732 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8AP01732 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8AP01732 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8AP01732 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8AP01732 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8AP01732 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD8AP01732 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD8AP01732 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8AP01732 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8AP01732 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8AP01732 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8AP01732 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8AP01732 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8AP01732 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8AP01732 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8AP01732 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8AP01732 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8AP01732 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8AP01732 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8AP01732 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD8AP01732 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8AP01732 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8AP01732 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD8AP01732 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8AP01732 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8AP01732 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8AP01732 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8AP01732 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD8AP01732 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD8AP01732 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CD8AP01732 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8AP01732 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8AP01732 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8AP01732 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8AP01732 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8AP01732 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD8AP01732 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD8AP01732 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD8AP01732 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD8AP01732 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD8AP01732 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD8AP01732 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD8AP01732 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD8AP01732 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD8AP01732 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD8AP01732 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD8AP01732 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD8AP01732 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8AP01732 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8AP01732 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8AP01732 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8AP01732 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8AP01732 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8AP01732 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8AP01732 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8AP01732 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8AP01732 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8AP01732 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8AP01732 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8AP01732 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8AP01732 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD8AP01732 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD8AP01732 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD8AP01732 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD8AP01732 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD8AP01732 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD8AP01732 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8AP01732 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8AP01732 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD8AP01732 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8AP01732 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8AP01732 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8AP01732 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD8AP01732 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms