Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIPP01282 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIPP01282 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIPP01282 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VIPP01282 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VIPP01282 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIPP01282 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIPP01282 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIPP01282 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIPP01282 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIPP01282 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VIPP01282 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VIPP01282 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VIPP01282 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIPP01282 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VIPP01282 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIPP01282 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIPP01282 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIPP01282 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIPP01282 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VIPP01282 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VIPP01282 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VIPP01282 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VIPP01282 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VIPP01282 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VIPP01282 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VIPP01282 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIPP01282 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VIPP01282 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VIPP01282 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIPP01282 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIPP01282 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIPP01282 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VIPP01282 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VIPP01282 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIPP01282 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIPP01282 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIPP01282 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIPP01282 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIPP01282 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIPP01282 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIPP01282 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIPP01282 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIPP01282 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIPP01282 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VIPP01282 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIPP01282 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VIPP01282 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VIPP01282 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VIPP01282 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VIPP01282 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VIPP01282 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VIPP01282 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VIPP01282 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VIPP01282 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VIPP01282 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VIPP01282 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VIPP01282 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VIPP01282 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VIPP01282 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VIPP01282 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VIPP01282 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VIPP01282 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VIPP01282 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VIPP01282 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VIPP01282 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VIPP01282 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VIPP01282 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VIPP01282 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VIPP01282 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VIPP01282 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VIPP01282 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VIPP01282 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VIPP01282 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VIPP01282 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VIPP01282 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VIPP01282 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VIPP01282 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VIPP01282 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VIPP01282 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VIPP01282 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIPP01282 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIPP01282 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIPP01282 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VIPP01282 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIPP01282 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIPP01282 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIPP01282 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIPP01282 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIPP01282 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIPP01282 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIPP01282 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIPP01282 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIPP01282 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIPP01282 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIPP01282 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIPP01282 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VIPP01282 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIPP01282 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIPP01282 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms