Protein–RNA interactions for Protein: O95810

CAVIN2, Caveolae-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN2O95810 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAVIN2O95810 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAVIN2O95810 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CAVIN2O95810 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAVIN2O95810 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAVIN2O95810 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CAVIN2O95810 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CAVIN2O95810 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAVIN2O95810 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CAVIN2O95810 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAVIN2O95810 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAVIN2O95810 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAVIN2O95810 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CAVIN2O95810 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CAVIN2O95810 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAVIN2O95810 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAVIN2O95810 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAVIN2O95810 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAVIN2O95810 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CAVIN2O95810 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CAVIN2O95810 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CAVIN2O95810 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CAVIN2O95810 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAVIN2O95810 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAVIN2O95810 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CAVIN2O95810 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CAVIN2O95810 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAVIN2O95810 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAVIN2O95810 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAVIN2O95810 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CAVIN2O95810 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CAVIN2O95810 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN2O95810 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CAVIN2O95810 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CAVIN2O95810 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAVIN2O95810 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAVIN2O95810 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAVIN2O95810 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAVIN2O95810 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN2O95810 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN2O95810 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN2O95810 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN2O95810 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CAVIN2O95810 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CAVIN2O95810 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN2O95810 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN2O95810 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN2O95810 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN2O95810 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CAVIN2O95810 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAVIN2O95810 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAVIN2O95810 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAVIN2O95810 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAVIN2O95810 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAVIN2O95810 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAVIN2O95810 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAVIN2O95810 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAVIN2O95810 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms