Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNUPNO95149 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNUPNO95149 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNUPNO95149 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNUPNO95149 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNUPNO95149 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNUPNO95149 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNUPNO95149 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNUPNO95149 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNUPNO95149 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SNUPNO95149 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNUPNO95149 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNUPNO95149 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNUPNO95149 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNUPNO95149 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNUPNO95149 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNUPNO95149 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNUPNO95149 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNUPNO95149 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNUPNO95149 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNUPNO95149 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNUPNO95149 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms