Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SNUPNO95149 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SNUPNO95149 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SNUPNO95149 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SNUPNO95149 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SNUPNO95149 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SNUPNO95149 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SNUPNO95149 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SNUPNO95149 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SNUPNO95149 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SNUPNO95149 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SNUPNO95149 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SNUPNO95149 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SNUPNO95149 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNUPNO95149 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNUPNO95149 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNUPNO95149 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNUPNO95149 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNUPNO95149 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNUPNO95149 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SNUPNO95149 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SNUPNO95149 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNUPNO95149 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNUPNO95149 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SNUPNO95149 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SNUPNO95149 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNUPNO95149 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SNUPNO95149 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNUPNO95149 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNUPNO95149 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNUPNO95149 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNUPNO95149 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNUPNO95149 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SNUPNO95149 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNUPNO95149 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNUPNO95149 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNUPNO95149 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNUPNO95149 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNUPNO95149 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SNUPNO95149 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNUPNO95149 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNUPNO95149 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNUPNO95149 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNUPNO95149 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNUPNO95149 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNUPNO95149 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNUPNO95149 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNUPNO95149 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNUPNO95149 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNUPNO95149 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNUPNO95149 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNUPNO95149 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNUPNO95149 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNUPNO95149 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNUPNO95149 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNUPNO95149 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNUPNO95149 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNUPNO95149 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNUPNO95149 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNUPNO95149 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNUPNO95149 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNUPNO95149 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNUPNO95149 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNUPNO95149 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNUPNO95149 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNUPNO95149 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNUPNO95149 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNUPNO95149 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNUPNO95149 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNUPNO95149 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNUPNO95149 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNUPNO95149 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNUPNO95149 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNUPNO95149 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNUPNO95149 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNUPNO95149 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNUPNO95149 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNUPNO95149 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNUPNO95149 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNUPNO95149 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNUPNO95149 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNUPNO95149 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNUPNO95149 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNUPNO95149 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNUPNO95149 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNUPNO95149 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNUPNO95149 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNUPNO95149 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNUPNO95149 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNUPNO95149 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNUPNO95149 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SNUPNO95149 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNUPNO95149 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNUPNO95149 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNUPNO95149 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNUPNO95149 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNUPNO95149 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNUPNO95149 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNUPNO95149 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNUPNO95149 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms