Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TRPM2O94759 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TRPM2O94759 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TRPM2O94759 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TRPM2O94759 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
TRPM2O94759 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TRPM2O94759 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
TRPM2O94759 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TRPM2O94759 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
TRPM2O94759 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TRPM2O94759 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TRPM2O94759 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TRPM2O94759 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TRPM2O94759 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TRPM2O94759 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TRPM2O94759 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TRPM2O94759 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TRPM2O94759 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TRPM2O94759 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TRPM2O94759 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TRPM2O94759 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TRPM2O94759 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
TRPM2O94759 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TRPM2O94759 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TRPM2O94759 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TRPM2O94759 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
TRPM2O94759 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TRPM2O94759 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TRPM2O94759 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TRPM2O94759 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
TRPM2O94759 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
TRPM2O94759 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
TRPM2O94759 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
TRPM2O94759 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TRPM2O94759 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRPM2O94759 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRPM2O94759 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRPM2O94759 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRPM2O94759 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
TRPM2O94759 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
TRPM2O94759 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRPM2O94759 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRPM2O94759 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRPM2O94759 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRPM2O94759 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRPM2O94759 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRPM2O94759 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRPM2O94759 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TRPM2O94759 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TRPM2O94759 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TRPM2O94759 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRPM2O94759 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRPM2O94759 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRPM2O94759 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TRPM2O94759 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRPM2O94759 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRPM2O94759 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRPM2O94759 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRPM2O94759 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
TRPM2O94759 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
TRPM2O94759 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRPM2O94759 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
TRPM2O94759 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms