Protein–RNA interactions for Protein: O75771

RAD51D, DNA repair protein RAD51 homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51DO75771 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51DO75771 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD51DO75771 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD51DO75771 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51DO75771 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51DO75771 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD51DO75771 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51DO75771 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms