Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCM2O75603 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCM2O75603 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCM2O75603 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCM2O75603 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCM2O75603 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCM2O75603 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCM2O75603 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCM2O75603 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCM2O75603 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCM2O75603 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCM2O75603 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCM2O75603 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCM2O75603 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GCM2O75603 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCM2O75603 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCM2O75603 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCM2O75603 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCM2O75603 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCM2O75603 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCM2O75603 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCM2O75603 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCM2O75603 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCM2O75603 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCM2O75603 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCM2O75603 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCM2O75603 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCM2O75603 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCM2O75603 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCM2O75603 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCM2O75603 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCM2O75603 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCM2O75603 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCM2O75603 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCM2O75603 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCM2O75603 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCM2O75603 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCM2O75603 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCM2O75603 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCM2O75603 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCM2O75603 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCM2O75603 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCM2O75603 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCM2O75603 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCM2O75603 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCM2O75603 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCM2O75603 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCM2O75603 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCM2O75603 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCM2O75603 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCM2O75603 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCM2O75603 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GCM2O75603 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GCM2O75603 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCM2O75603 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCM2O75603 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCM2O75603 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCM2O75603 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCM2O75603 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCM2O75603 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCM2O75603 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCM2O75603 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCM2O75603 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCM2O75603 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCM2O75603 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCM2O75603 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCM2O75603 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCM2O75603 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCM2O75603 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCM2O75603 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GCM2O75603 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCM2O75603 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCM2O75603 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCM2O75603 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCM2O75603 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCM2O75603 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GCM2O75603 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCM2O75603 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCM2O75603 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCM2O75603 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCM2O75603 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCM2O75603 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCM2O75603 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCM2O75603 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCM2O75603 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCM2O75603 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCM2O75603 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCM2O75603 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCM2O75603 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCM2O75603 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCM2O75603 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCM2O75603 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCM2O75603 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCM2O75603 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCM2O75603 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCM2O75603 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCM2O75603 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCM2O75603 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCM2O75603 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCM2O75603 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms