Protein–RNA interactions for Protein: O75185

ATP2C2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C2O75185 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2C2O75185 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2C2O75185 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2C2O75185 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2C2O75185 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2C2O75185 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2C2O75185 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2C2O75185 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2C2O75185 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2C2O75185 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2C2O75185 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2C2O75185 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2C2O75185 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2C2O75185 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2C2O75185 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATP2C2O75185 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2C2O75185 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2C2O75185 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2C2O75185 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2C2O75185 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2C2O75185 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2C2O75185 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2C2O75185 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2C2O75185 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2C2O75185 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2C2O75185 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2C2O75185 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2C2O75185 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2C2O75185 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2C2O75185 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2C2O75185 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2C2O75185 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2C2O75185 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2C2O75185 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2C2O75185 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2C2O75185 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2C2O75185 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2C2O75185 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2C2O75185 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2C2O75185 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2C2O75185 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2C2O75185 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2C2O75185 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2C2O75185 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2C2O75185 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2C2O75185 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2C2O75185 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2C2O75185 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2C2O75185 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms