Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM4AO75164 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM4AO75164 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM4AO75164 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM4AO75164 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM4AO75164 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM4AO75164 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM4AO75164 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM4AO75164 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM4AO75164 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM4AO75164 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM4AO75164 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM4AO75164 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM4AO75164 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM4AO75164 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM4AO75164 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM4AO75164 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM4AO75164 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM4AO75164 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM4AO75164 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM4AO75164 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM4AO75164 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM4AO75164 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM4AO75164 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KDM4AO75164 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM4AO75164 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KDM4AO75164 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
KDM4AO75164 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KDM4AO75164 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KDM4AO75164 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KDM4AO75164 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KDM4AO75164 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KDM4AO75164 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KDM4AO75164 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KDM4AO75164 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KDM4AO75164 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KDM4AO75164 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KDM4AO75164 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KDM4AO75164 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KDM4AO75164 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KDM4AO75164 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KDM4AO75164 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDM4AO75164 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDM4AO75164 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDM4AO75164 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM4AO75164 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDM4AO75164 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KDM4AO75164 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KDM4AO75164 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM4AO75164 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM4AO75164 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM4AO75164 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM4AO75164 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM4AO75164 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM4AO75164 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms