Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX2O60749 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX2O60749 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX2O60749 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX2O60749 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX2O60749 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX2O60749 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX2O60749 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX2O60749 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX2O60749 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX2O60749 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX2O60749 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX2O60749 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX2O60749 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX2O60749 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX2O60749 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX2O60749 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX2O60749 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX2O60749 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX2O60749 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX2O60749 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX2O60749 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX2O60749 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX2O60749 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX2O60749 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX2O60749 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX2O60749 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX2O60749 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX2O60749 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX2O60749 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX2O60749 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX2O60749 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX2O60749 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX2O60749 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX2O60749 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX2O60749 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX2O60749 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX2O60749 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX2O60749 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX2O60749 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX2O60749 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX2O60749 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX2O60749 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX2O60749 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX2O60749 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX2O60749 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX2O60749 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX2O60749 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX2O60749 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX2O60749 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX2O60749 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX2O60749 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX2O60749 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX2O60749 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX2O60749 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX2O60749 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX2O60749 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX2O60749 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX2O60749 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX2O60749 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX2O60749 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX2O60749 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX2O60749 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX2O60749 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX2O60749 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX2O60749 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX2O60749 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX2O60749 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX2O60749 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX2O60749 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX2O60749 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX2O60749 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX2O60749 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX2O60749 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX2O60749 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX2O60749 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX2O60749 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX2O60749 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX2O60749 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX2O60749 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX2O60749 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX2O60749 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX2O60749 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX2O60749 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX2O60749 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX2O60749 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX2O60749 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX2O60749 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX2O60749 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX2O60749 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX2O60749 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX2O60749 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX2O60749 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX2O60749 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX2O60749 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX2O60749 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX2O60749 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNX2O60749 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX2O60749 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX2O60749 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms