Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD6O60522 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD6O60522 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD6O60522 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TDRD6O60522 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD6O60522 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD6O60522 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD6O60522 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD6O60522 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD6O60522 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD6O60522 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD6O60522 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD6O60522 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TDRD6O60522 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TDRD6O60522 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TDRD6O60522 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms