Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDUFB5O43674 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFB5O43674 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFB5O43674 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFB5O43674 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFB5O43674 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFB5O43674 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFB5O43674 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFB5O43674 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFB5O43674 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFB5O43674 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFB5O43674 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFB5O43674 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFB5O43674 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms