Protein–RNA interactions for Protein: O43561

LAT, Linker for activation of T-cells family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATO43561 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LATO43561 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LATO43561 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LATO43561 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LATO43561 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LATO43561 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LATO43561 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LATO43561 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LATO43561 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LATO43561 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LATO43561 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LATO43561 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LATO43561 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LATO43561 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LATO43561 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LATO43561 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LATO43561 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LATO43561 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LATO43561 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LATO43561 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LATO43561 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LATO43561 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LATO43561 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LATO43561 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LATO43561 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LATO43561 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LATO43561 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LATO43561 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LATO43561 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LATO43561 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LATO43561 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LATO43561 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LATO43561 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LATO43561 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LATO43561 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LATO43561 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LATO43561 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LATO43561 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LATO43561 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LATO43561 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LATO43561 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LATO43561 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LATO43561 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LATO43561 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LATO43561 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LATO43561 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LATO43561 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LATO43561 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LATO43561 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LATO43561 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LATO43561 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LATO43561 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LATO43561 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LATO43561 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LATO43561 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LATO43561 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LATO43561 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LATO43561 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LATO43561 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LATO43561 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LATO43561 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LATO43561 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LATO43561 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LATO43561 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LATO43561 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LATO43561 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LATO43561 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LATO43561 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LATO43561 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LATO43561 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LATO43561 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LATO43561 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LATO43561 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LATO43561 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LATO43561 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LATO43561 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LATO43561 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LATO43561 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LATO43561 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LATO43561 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LATO43561 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LATO43561 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LATO43561 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LATO43561 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LATO43561 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LATO43561 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LATO43561 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LATO43561 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LATO43561 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LATO43561 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LATO43561 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LATO43561 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LATO43561 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LATO43561 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LATO43561 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LATO43561 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LATO43561 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LATO43561 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LATO43561 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LATO43561 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms