Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUV39H1O43463 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUV39H1O43463 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUV39H1O43463 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUV39H1O43463 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUV39H1O43463 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUV39H1O43463 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUV39H1O43463 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUV39H1O43463 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUV39H1O43463 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SUV39H1O43463 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUV39H1O43463 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUV39H1O43463 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SUV39H1O43463 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUV39H1O43463 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUV39H1O43463 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUV39H1O43463 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SUV39H1O43463 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUV39H1O43463 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUV39H1O43463 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUV39H1O43463 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUV39H1O43463 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUV39H1O43463 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms