Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MEFVO15553 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MEFVO15553 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MEFVO15553 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MEFVO15553 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MEFVO15553 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MEFVO15553 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MEFVO15553 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MEFVO15553 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MEFVO15553 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MEFVO15553 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MEFVO15553 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MEFVO15553 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MEFVO15553 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MEFVO15553 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MEFVO15553 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MEFVO15553 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MEFVO15553 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEFVO15553 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEFVO15553 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEFVO15553 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEFVO15553 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEFVO15553 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEFVO15553 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEFVO15553 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEFVO15553 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MEFVO15553 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MEFVO15553 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MEFVO15553 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MEFVO15553 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEFVO15553 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MEFVO15553 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MEFVO15553 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MEFVO15553 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MEFVO15553 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MEFVO15553 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MEFVO15553 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MEFVO15553 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEFVO15553 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MEFVO15553 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEFVO15553 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEFVO15553 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MEFVO15553 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MEFVO15553 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MEFVO15553 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MEFVO15553 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MEFVO15553 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MEFVO15553 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEFVO15553 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MEFVO15553 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MEFVO15553 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEFVO15553 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEFVO15553 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEFVO15553 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEFVO15553 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MEFVO15553 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEFVO15553 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEFVO15553 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEFVO15553 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEFVO15553 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MEFVO15553 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MEFVO15553 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEFVO15553 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MEFVO15553 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEFVO15553 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEFVO15553 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEFVO15553 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEFVO15553 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MEFVO15553 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MEFVO15553 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MEFVO15553 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MEFVO15553 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEFVO15553 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEFVO15553 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MEFVO15553 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEFVO15553 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEFVO15553 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEFVO15553 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MEFVO15553 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEFVO15553 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEFVO15553 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEFVO15553 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MEFVO15553 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEFVO15553 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEFVO15553 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEFVO15553 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MEFVO15553 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEFVO15553 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MEFVO15553 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MEFVO15553 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MEFVO15553 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEFVO15553 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEFVO15553 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MEFVO15553 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MEFVO15553 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEFVO15553 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MEFVO15553 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEFVO15553 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MEFVO15553 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MEFVO15553 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms