Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLDN3O15551 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLDN3O15551 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLDN3O15551 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CLDN3O15551 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLDN3O15551 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLDN3O15551 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLDN3O15551 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLDN3O15551 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLDN3O15551 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLDN3O15551 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLDN3O15551 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLDN3O15551 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLDN3O15551 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLDN3O15551 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLDN3O15551 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLDN3O15551 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLDN3O15551 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLDN3O15551 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLDN3O15551 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLDN3O15551 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLDN3O15551 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLDN3O15551 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLDN3O15551 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLDN3O15551 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLDN3O15551 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLDN3O15551 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLDN3O15551 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLDN3O15551 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLDN3O15551 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLDN3O15551 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLDN3O15551 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLDN3O15551 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLDN3O15551 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLDN3O15551 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLDN3O15551 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLDN3O15551 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLDN3O15551 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLDN3O15551 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CLDN3O15551 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLDN3O15551 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLDN3O15551 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLDN3O15551 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLDN3O15551 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLDN3O15551 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLDN3O15551 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLDN3O15551 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLDN3O15551 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLDN3O15551 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CLDN3O15551 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms