Protein–RNA interactions for Protein: O15355

PPM1G, Protein phosphatase 1G, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1GO15355 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPM1GO15355 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPM1GO15355 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PPM1GO15355 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PPM1GO15355 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPM1GO15355 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PPM1GO15355 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPM1GO15355 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPM1GO15355 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PPM1GO15355 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPM1GO15355 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPM1GO15355 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PPM1GO15355 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPM1GO15355 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPM1GO15355 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPM1GO15355 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPM1GO15355 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPM1GO15355 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPM1GO15355 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPM1GO15355 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPM1GO15355 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPM1GO15355 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PPM1GO15355 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PPM1GO15355 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PPM1GO15355 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPM1GO15355 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPM1GO15355 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPM1GO15355 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPM1GO15355 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PPM1GO15355 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PPM1GO15355 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PPM1GO15355 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PPM1GO15355 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PPM1GO15355 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PPM1GO15355 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PPM1GO15355 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PPM1GO15355 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PPM1GO15355 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PPM1GO15355 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PPM1GO15355 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PPM1GO15355 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PPM1GO15355 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PPM1GO15355 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PPM1GO15355 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PPM1GO15355 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PPM1GO15355 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PPM1GO15355 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PPM1GO15355 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPM1GO15355 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPM1GO15355 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPM1GO15355 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPM1GO15355 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PPM1GO15355 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPM1GO15355 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPM1GO15355 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms