Protein–RNA interactions for Protein: O14836

TNFRSF13B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13BO14836 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF13BO14836 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF13BO14836 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF13BO14836 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF13BO14836 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF13BO14836 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF13BO14836 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF13BO14836 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF13BO14836 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF13BO14836 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF13BO14836 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF13BO14836 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF13BO14836 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF13BO14836 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF13BO14836 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF13BO14836 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF13BO14836 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF13BO14836 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF13BO14836 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF13BO14836 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF13BO14836 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF13BO14836 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF13BO14836 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF13BO14836 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF13BO14836 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF13BO14836 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF13BO14836 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF13BO14836 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF13BO14836 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF13BO14836 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF13BO14836 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms