Protein–RNA interactions for Protein: O14519

CDK2AP1, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP1O14519 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK2AP1O14519 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK2AP1O14519 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK2AP1O14519 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK2AP1O14519 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK2AP1O14519 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK2AP1O14519 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK2AP1O14519 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK2AP1O14519 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK2AP1O14519 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK2AP1O14519 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms