Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT5O00445 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT5O00445 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT5O00445 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT5O00445 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT5O00445 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT5O00445 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT5O00445 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT5O00445 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT5O00445 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT5O00445 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT5O00445 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT5O00445 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT5O00445 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT5O00445 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT5O00445 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT5O00445 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT5O00445 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT5O00445 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT5O00445 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT5O00445 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYT5O00445 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYT5O00445 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYT5O00445 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT5O00445 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT5O00445 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT5O00445 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYT5O00445 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYT5O00445 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYT5O00445 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT5O00445 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYT5O00445 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT5O00445 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT5O00445 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYT5O00445 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYT5O00445 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT5O00445 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYT5O00445 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT5O00445 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT5O00445 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT5O00445 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT5O00445 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT5O00445 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT5O00445 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT5O00445 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT5O00445 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT5O00445 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT5O00445 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT5O00445 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT5O00445 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT5O00445 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYT5O00445 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SYT5O00445 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT5O00445 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT5O00445 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT5O00445 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT5O00445 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT5O00445 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT5O00445 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT5O00445 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT5O00445 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT5O00445 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT5O00445 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT5O00445 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT5O00445 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT5O00445 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT5O00445 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT5O00445 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT5O00445 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT5O00445 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT5O00445 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT5O00445 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT5O00445 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT5O00445 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT5O00445 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT5O00445 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT5O00445 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT5O00445 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT5O00445 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT5O00445 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT5O00445 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT5O00445 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT5O00445 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT5O00445 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT5O00445 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYT5O00445 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYT5O00445 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT5O00445 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT5O00445 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT5O00445 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT5O00445 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT5O00445 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT5O00445 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT5O00445 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT5O00445 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT5O00445 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT5O00445 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT5O00445 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT5O00445 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT5O00445 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms