Protein–RNA interactions for Protein: O00337

SLC28A1, Sodium/nucleoside cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A1O00337 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC28A1O00337 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC28A1O00337 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC28A1O00337 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC28A1O00337 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC28A1O00337 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC28A1O00337 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC28A1O00337 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC28A1O00337 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC28A1O00337 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC28A1O00337 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC28A1O00337 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC28A1O00337 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC28A1O00337 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC28A1O00337 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC28A1O00337 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC28A1O00337 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC28A1O00337 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC28A1O00337 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC28A1O00337 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC28A1O00337 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC28A1O00337 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC28A1O00337 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC28A1O00337 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC28A1O00337 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC28A1O00337 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC28A1O00337 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC28A1O00337 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC28A1O00337 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms