Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGRPO00253 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AGRPO00253 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGRPO00253 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
AGRPO00253 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGRPO00253 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
AGRPO00253 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGRPO00253 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGRPO00253 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGRPO00253 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGRPO00253 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGRPO00253 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGRPO00253 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGRPO00253 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGRPO00253 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGRPO00253 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGRPO00253 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGRPO00253 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGRPO00253 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGRPO00253 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
AGRPO00253 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AGRPO00253 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGRPO00253 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AGRPO00253 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGRPO00253 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGRPO00253 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGRPO00253 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGRPO00253 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGRPO00253 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGRPO00253 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGRPO00253 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGRPO00253 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGRPO00253 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGRPO00253 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGRPO00253 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGRPO00253 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGRPO00253 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGRPO00253 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGRPO00253 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGRPO00253 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGRPO00253 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGRPO00253 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGRPO00253 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGRPO00253 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGRPO00253 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGRPO00253 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGRPO00253 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGRPO00253 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGRPO00253 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGRPO00253 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGRPO00253 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGRPO00253 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGRPO00253 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGRPO00253 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGRPO00253 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGRPO00253 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGRPO00253 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGRPO00253 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGRPO00253 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AGRPO00253 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGRPO00253 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGRPO00253 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGRPO00253 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGRPO00253 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGRPO00253 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGRPO00253 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGRPO00253 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGRPO00253 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGRPO00253 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGRPO00253 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGRPO00253 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGRPO00253 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGRPO00253 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
AGRPO00253 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGRPO00253 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGRPO00253 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGRPO00253 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGRPO00253 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGRPO00253 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGRPO00253 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGRPO00253 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGRPO00253 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGRPO00253 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGRPO00253 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGRPO00253 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGRPO00253 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGRPO00253 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGRPO00253 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGRPO00253 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGRPO00253 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGRPO00253 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGRPO00253 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGRPO00253 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGRPO00253 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGRPO00253 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGRPO00253 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGRPO00253 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGRPO00253 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGRPO00253 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGRPO00253 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms