Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CROCC2H7BZ55 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CROCC2H7BZ55 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CROCC2H7BZ55 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CROCC2H7BZ55 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CROCC2H7BZ55 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CROCC2H7BZ55 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CROCC2H7BZ55 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CROCC2H7BZ55 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CROCC2H7BZ55 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CROCC2H7BZ55 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CROCC2H7BZ55 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CROCC2H7BZ55 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CROCC2H7BZ55 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
CROCC2H7BZ55 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CROCC2H7BZ55 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CROCC2H7BZ55 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CROCC2H7BZ55 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CROCC2H7BZ55 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CROCC2H7BZ55 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CROCC2H7BZ55 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CROCC2H7BZ55 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CROCC2H7BZ55 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CROCC2H7BZ55 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CROCC2H7BZ55 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CROCC2H7BZ55 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CROCC2H7BZ55 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
CROCC2H7BZ55 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CROCC2H7BZ55 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CROCC2H7BZ55 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.11
CROCC2H7BZ55 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CROCC2H7BZ55 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms