Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPCL3B7ZW38 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNRNPCL3B7ZW38 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNRNPCL3B7ZW38 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNRNPCL3B7ZW38 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNRNPCL3B7ZW38 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HNRNPCL3B7ZW38 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNRNPCL3B7ZW38 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HNRNPCL3B7ZW38 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HNRNPCL3B7ZW38 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HNRNPCL3B7ZW38 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNRNPCL3B7ZW38 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNRNPCL3B7ZW38 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNRNPCL3B7ZW38 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNRNPCL3B7ZW38 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNRNPCL3B7ZW38 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNRNPCL3B7ZW38 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNRNPCL3B7ZW38 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNRNPCL3B7ZW38 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNRNPCL3B7ZW38 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HNRNPCL3B7ZW38 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HNRNPCL3B7ZW38 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HNRNPCL3B7ZW38 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HNRNPCL3B7ZW38 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HNRNPCL3B7ZW38 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPCL3B7ZW38 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPCL3B7ZW38 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPCL3B7ZW38 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HNRNPCL3B7ZW38 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HNRNPCL3B7ZW38 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HNRNPCL3B7ZW38 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms