Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNJ18B7U540 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNJ18B7U540 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNJ18B7U540 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCNJ18B7U540 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KCNJ18B7U540 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KCNJ18B7U540 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCNJ18B7U540 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCNJ18B7U540 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KCNJ18B7U540 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KCNJ18B7U540 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KCNJ18B7U540 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KCNJ18B7U540 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCNJ18B7U540 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KCNJ18B7U540 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KCNJ18B7U540 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KCNJ18B7U540 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KCNJ18B7U540 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCNJ18B7U540 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCNJ18B7U540 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCNJ18B7U540 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCNJ18B7U540 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCNJ18B7U540 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCNJ18B7U540 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCNJ18B7U540 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCNJ18B7U540 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCNJ18B7U540 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KCNJ18B7U540 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KCNJ18B7U540 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNJ18B7U540 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNJ18B7U540 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KCNJ18B7U540 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNJ18B7U540 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNJ18B7U540 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KCNJ18B7U540 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNJ18B7U540 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms