Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A8MVJ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A8MVJ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A8MVJ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A8MVJ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A8MVJ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A8MVJ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A8MVJ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A8MVJ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A8MVJ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A8MVJ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A8MVJ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A8MVJ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A8MVJ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A8MVJ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
A8MVJ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
A8MVJ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A8MVJ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A8MVJ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A8MVJ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A8MVJ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A8MVJ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A8MVJ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A8MVJ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A8MVJ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A8MVJ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A8MVJ9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A8MVJ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A8MVJ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A8MVJ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A8MVJ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A8MVJ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A8MVJ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A8MVJ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A8MVJ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
A8MVJ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A8MVJ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A8MVJ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A8MVJ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A8MVJ9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A8MVJ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A8MVJ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A8MVJ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A8MVJ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A8MVJ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A8MVJ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A8MVJ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A8MVJ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A8MVJ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A8MVJ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A8MVJ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A8MVJ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A8MVJ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A8MVJ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A8MVJ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A8MVJ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A8MVJ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A8MVJ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A8MVJ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A8MVJ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A8MVJ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A8MVJ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A8MVJ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A8MVJ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A8MVJ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A8MVJ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A8MVJ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A8MVJ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A8MVJ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A8MVJ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A8MVJ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A8MVJ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
A8MVJ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A8MVJ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A8MVJ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MVJ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MVJ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MVJ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MVJ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MVJ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MVJ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MVJ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MVJ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MVJ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MVJ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A8MVJ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A8MVJ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MVJ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MVJ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MVJ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A8MVJ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A8MVJ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A8MVJ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MVJ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MVJ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A8MVJ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A8MVJ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A8MVJ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MVJ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MVJ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms