Protein–RNA interactions for Protein: A8MTZ7

C12orf71, Uncharacterized protein C12orf71, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf71A8MTZ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf71A8MTZ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf71A8MTZ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf71A8MTZ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf71A8MTZ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf71A8MTZ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf71A8MTZ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf71A8MTZ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf71A8MTZ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf71A8MTZ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf71A8MTZ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf71A8MTZ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf71A8MTZ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C12orf71A8MTZ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C12orf71A8MTZ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C12orf71A8MTZ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf71A8MTZ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf71A8MTZ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf71A8MTZ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf71A8MTZ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf71A8MTZ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf71A8MTZ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf71A8MTZ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms