Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM247A6NEH6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM247A6NEH6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM247A6NEH6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM247A6NEH6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM247A6NEH6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM247A6NEH6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM247A6NEH6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM247A6NEH6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM247A6NEH6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM247A6NEH6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM247A6NEH6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM247A6NEH6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM247A6NEH6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM247A6NEH6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM247A6NEH6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM247A6NEH6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM247A6NEH6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM247A6NEH6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM247A6NEH6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM247A6NEH6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM247A6NEH6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM247A6NEH6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM247A6NEH6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM247A6NEH6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM247A6NEH6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms