Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX0

CIB4, Calcium and integrin-binding family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB4A0PJX0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIB4A0PJX0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIB4A0PJX0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CIB4A0PJX0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CIB4A0PJX0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIB4A0PJX0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIB4A0PJX0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms