Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR47

SPTY2D1-AS1, SPTY2D1 antisense RNA 1, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms