Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 NDUFB8-207ENST00000529437 602 ntTSL 215.4■□□□□ 0.066e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.126e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 NDUFB8-206ENST00000528425 608 ntTSL 414□□□□□ -0.176e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-219ENST00000509409 1248 ntTSL 213.77□□□□□ -0.26e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.226e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 NDUFB8-205ENST00000466088 829 ntTSL 213.58□□□□□ -0.246e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.276e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.36e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 AL133352.1-202ENST00000527595 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.11□□□□□ -0.316e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.356e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.516e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-216ENST00000473036 746 ntTSL 211.75□□□□□ -0.536e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 DHRS2-207ENST00000556701 3157 ntTSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.66e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.646e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.646e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.686e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.76e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 AL133352.1-201ENST00000529568 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.46□□□□□ -0.736e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 AL133352.1-205ENST00000533549 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.4□□□□□ -0.746e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.766e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.826e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 29.3□□□□□ -0.926e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.966e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-210ENST00000368530 1523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.966e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -16e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 PKIB-212ENST00000618977 464 ntTSL 38.76□□□□□ -1.016e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.036e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.076e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 58.31□□□□□ -1.086e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.096e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TTC17-201ENST00000039989 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.096e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-218ENST00000505010 540 ntTSL 28.22□□□□□ -1.096e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.096e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 SMARCC2-208ENST00000550150 3244 ntTSL 27.94□□□□□ -1.146e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 SMARCC2-214ENST00000552674 3730 ntTSL 26.43□□□□□ -1.386e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.416e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 25.81□□□□□ -1.486e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 TAX1BP1-208ENST00000457186 1174 ntTSL 55.33□□□□□ -1.566e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 TTC17-203ENST00000418561 575 ntTSL 34.68□□□□□ -1.666e-7■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.76e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 BRD8-215ENST00000460746 475 ntTSL 51.06□□□□□ -2.246e-7■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 SEMA4C-204ENST00000467747 3371 ntTSL 210.7□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 SEMA4C-206ENST00000482925 3776 ntTSL 29.71□□□□□ -0.852e-6■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 59.66□□□□□ -0.863e-46■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 STK11-207ENST00000589152 3365 ntTSL 29.95□□□□□ -0.821e-6■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 LRRC75A-AS1-219ENST00000578757 920 ntTSL 1 (best)11.72□□□□□ -0.532e-6■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-6■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.564e-6■■■□□ 15
NIPBLQ6KC79 ZNF767P-203ENST00000481762 357 ntTSL 37.34□□□□□ -1.234e-6■■■□□ 15
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NIPBLQ6KC79 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.373e-7■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.523e-7■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 ATAD2-203ENST00000519124 4650 ntTSL 1 (best)4.86□□□□□ -1.633e-7■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.322e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.472e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.482e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.492e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)5.74□□□□□ -1.492e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.372e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 413.77□□□□□ -0.24e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.364e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.383e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.413e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 210.48□□□□□ -0.733e-6■■■□□ 14.9
NIPBLQ6KC79 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.763e-6■■■□□ 14.9
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