Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.724e-7■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MYSM1-201ENST00000401044 3176 ntTSL 1 (best)3.72□□□□□ -1.814e-7■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MYSM1-207ENST00000493821 7793 ntTSL 1 (best)2.24□□□□□ -2.054e-7■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PTK2-252ENST00000523803 750 ntTSL 39.1□□□□□ -0.959e-8■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PTK2-235ENST00000521907 542 ntTSL 48.28□□□□□ -1.089e-8■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ACTR3-204ENST00000446821 818 ntTSL 317.87■□□□□ 0.455e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ACTR3-202ENST00000415792 676 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SCART1-201ENST00000462252 3451 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.312e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.872e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.712e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.412e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.382e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.312e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.22e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.182e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.172e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PDE7A-206ENST00000519626 522 ntTSL 427.88■■■□□ 2.052e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SMS-203ENST00000457085 931 ntTSL 527.56■■■□□ 22e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 22e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GPX4-211ENST00000614791 431 ntTSL 326.04■■□□□ 1.762e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-204ENST00000557961 591 ntTSL 226.03■■□□□ 1.762e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SRM-205ENST00000487300 611 ntTSL 224.63■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TPST2-205ENST00000442495 586 ntTSL 223.84■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MYCL-204ENST00000450953 426 ntTSL 423.52■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TPST2-209ENST00000454778 582 ntTSL 423.52■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FAM160B2-211ENST00000498344 917 ntTSL 223.4■■□□□ 1.342e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GAS6-202ENST00000476291 537 ntTSL 223.27■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ZSWIM8-219ENST00000604165 582 ntTSL 522.95■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FAM160B2-202ENST00000427751 932 ntTSL 522.93■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CIRBP-226ENST00000590171 905 ntTSL 322.58■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PDXDC1-207ENST00000562119 884 ntTSL 522.34■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CACTIN-207ENST00000589321 1708 ntTSL 522.18■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ARHGAP11A-204ENST00000563330 548 ntTSL 421.59■■□□□ 1.051e-11■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FBXW2-203ENST00000476481 661 ntTSL 321.45■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CACTIN-205ENST00000587175 2216 ntTSL 521.34■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CACTIN-209ENST00000591978 2283 nt21.22■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SEC22A-208ENST00000487572 870 ntTSL 321.19■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SEC22A-209ENST00000491366 482 ntTSL 321.19■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PDE7A-205ENST00000519231 685 ntTSL 521.04■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 IDH1-206ENST00000451391 563 ntTSL 320.8■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.921e-11■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 HES1-202ENST00000476918 1009 ntTSL 220.78■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SLC25A51-203ENST00000496760 1871 ntTSL 1 (best)20.76■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 OARD1-213ENST00000482853 1245 ntTSL 220.45■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-220ENST00000559930 678 ntTSL 420.02■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CALM1-207ENST00000553964 2670 ntTSL 1 (best)19.77■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TMEM59-208ENST00000452421 1074 ntTSL 519.75■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.731e-11■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.731e-11■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 DVL3-207ENST00000478247 2272 ntTSL 519.39■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PAM16-210ENST00000575636 732 ntTSL 319.35■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 L3MBTL1-211ENST00000457824 582 ntTSL 319.31■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CSNK1E-215ENST00000612795 885 ntTSL 219.16■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CALM1-208ENST00000553995 583 ntTSL 219.14■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CALM1-210ENST00000555132 554 ntTSL 419.14■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CALM1-213ENST00000556757 588 ntTSL 219.14■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CALM1-215ENST00000557123 569 ntTSL 319.14■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CALM1-206ENST00000553630 1420 ntTSL 519.11■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 KANSL2-213ENST00000550870 593 ntTSL 419.1■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 PAM16-205ENST00000571986 606 ntTSL 319.04■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.01■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TOP3B-217ENST00000489581 789 ntTSL 218.8■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CACTIN-204ENST00000585942 2810 ntTSL 1 (best)18.78■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 FAM160B2-208ENST00000488968 2702 ntTSL 218.63■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 AP3D1-211ENST00000591650 1437 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RAN-205ENST00000477395 762 ntTSL 518.54■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 RIPOR3-206ENST00000488529 953 ntTSL 518.41■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 43.1
SF3B1O75533 CDK5RAP3-207ENST00000578134 831 ntTSL 318.06■□□□□ 0.481e-11■■■■■ 43.1
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 596.1 ms