Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-6■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 49.63□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.891e-6■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 36.21□□□□□ -1.421e-7■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.843e-6■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 510.82□□□□□ -0.689e-10■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 PCBP2-218ENST00000550585 2543 ntTSL 59.33□□□□□ -0.926e-12■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.969e-10■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.25e-6■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 RTN4-211ENST00000438462 656 ntTSL 510.23□□□□□ -0.773e-8■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 XPO5-210ENST00000496341 800 ntTSL 54.48□□□□□ -1.693e-6■■■■□ 23.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.417e-8■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.497e-8■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-202ENST00000455864 880 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.617e-8■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-209ENST00000550171 1026 ntTSL 29.23□□□□□ -0.937e-8■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.165e-14■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.433e-9■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 SOCS2-209ENST00000549887 984 ntTSL 323.96■■□□□ 1.433e-9■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 SOCS2-204ENST00000548091 744 ntTSL 320.75■□□□□ 0.913e-9■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.83e-9■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYPLA1-210ENST00000521352 580 ntTSL 518.89■□□□□ 0.613e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYPLA1-209ENST00000520896 578 ntTSL 417.89■□□□□ 0.453e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYPLA1-206ENST00000519891 559 ntTSL 414□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.25e-14■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.25e-14■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYPLA1-204ENST00000518546 746 ntTSL 313.8□□□□□ -0.23e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 ANXA5-203ENST00000506395 1606 ntTSL 512.21□□□□□ -0.465e-14■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYPLA1-207ENST00000519926 857 ntTSL 311.32□□□□□ -0.63e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 MDH1-202ENST00000409476 808 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.698e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 MDH1-203ENST00000409908 700 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.698e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYPLA1-212ENST00000521898 344 ntTSL 510.6□□□□□ -0.713e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYPLA1-213ENST00000522007 250 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.783e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.88e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.838e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.868e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 MDH1-205ENST00000432309 844 ntTSL 58.89□□□□□ -0.998e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYPLA1-203ENST00000517297 927 ntTSL 1 (best)7.69□□□□□ -1.183e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 ANXA5-205ENST00000509648 1083 ntTSL 24.97□□□□□ -1.615e-14■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 NDUFS4-206ENST00000509443 450 ntTSL 24.61□□□□□ -1.674e-9■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 MDH1-204ENST00000421012 573 ntTSL 44.25□□□□□ -1.738e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 LCLAT1-211ENST00000491680 1610 ntTSL 211.28□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 R3HDM1-211ENST00000445855 670 ntTSL 55.59□□□□□ -1.514e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.346e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.016e-9■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 PHF3-204ENST00000481385 2787 ntTSL 214.1□□□□□ -0.156e-9■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 PHF3-205ENST00000494284 2854 ntTSL 212.41□□□□□ -0.426e-9■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 PHF3-208ENST00000506783 3700 ntTSL 1 (best)9.61□□□□□ -0.876e-9■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.566e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 CSNK2A2-206ENST00000567730 947 ntTSL 39.18□□□□□ -0.946e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 CSNK2A2-205ENST00000566813 1569 ntTSL 58.47□□□□□ -1.056e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.184e-8■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3L-209ENST00000460638 348 ntTSL 22.84□□□□□ -1.959e-8■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.035e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 PIP4K2A-208ENST00000605011 558 ntTSL 49.26□□□□□ -0.935e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.348e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 USB1-212ENST00000566082 3888 ntTSL 210.55□□□□□ -0.728e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.895e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 NBAS-208ENST00000442506 4391 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.963e-6■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 SERPINA1-211ENST00000553327 581 ntTSL 310.96□□□□□ -0.651e-323■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.183e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.23e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.34e-8■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.182e-7■■■■□ 23.2
IGF2BP1Q9NZI8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.059e-8■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 221.29■■□□□ 19e-8■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.269e-8■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.279e-8■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 411.09□□□□□ -0.639e-8■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-9■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 GTSF1-208ENST00000552395 671 ntTSL 57.49□□□□□ -1.211e-9■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 GTSF1-204ENST00000546931 902 ntTSL 57.27□□□□□ -1.251e-9■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.411e-9■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)6.95□□□□□ -1.31e-7■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 SAT1-206ENST00000463236 735 ntTSL 36.25□□□□□ -1.413e-7■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.121e-10■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.071e-10■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.891e-10■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.744e-7■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.114e-7■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.334e-8■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 STT3A-202ENST00000524639 582 ntTSL 25.21□□□□□ -1.589e-10■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.683e-7■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.893e-7■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.15e-7■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-7■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 ESD-203ENST00000412582 921 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.451e-6■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.551e-6■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.611e-6■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.631e-6■■■■□ 23.1
IGF2BP1Q9NZI8 R3HDM1-206ENST00000429703 3443 ntTSL 54.81□□□□□ -1.641e-6■■■■□ 23.1
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