Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NELFCDQ8IXH7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NELFCDQ8IXH7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NELFCDQ8IXH7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms