Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DEV8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DEV8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DEV8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DEV8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DEV8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DEV8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DEV8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DEV8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DEV8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DEV8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DEV8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DEV8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B4DEV8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms