Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H2AFXP16104 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFXP16104 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFXP16104 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFXP16104 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFXP16104 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms