Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDH10Q9P2E7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms