RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409943.7

CCDC74B-205, Transcript of coiled-coil domain containing 74B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC74B, Length 1,296 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74B-205ENST00000409943 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.72■■■■■ 5.87
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CCDC74B-205ENST00000409943 NACADO15069 1562 aa43.58■■■■■ 4.57
CCDC74B-205ENST00000409943 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.5■■■■■ 4.55
CCDC74B-205ENST00000409943 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.12■■■■■ 4.49
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CCDC74B-205ENST00000409943 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.72■■■■■ 4.43
CCDC74B-205ENST00000409943 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.4
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CCDC74B-205ENST00000409943 SCRIBQ14160 1630 aa42.17■■■■■ 4.34
CCDC74B-205ENST00000409943 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.06■■■■■ 4.32
CCDC74B-205ENST00000409943 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.96■■■■■ 4.31
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CCDC74B-205ENST00000409943 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.26■■■■■ 4.19
CCDC74B-205ENST00000409943 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.05■■■■■ 4.16
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CCDC74B-205ENST00000409943 SMARCA2P51531 1590 aa40.14■■■■■ 4.02
CCDC74B-205ENST00000409943 NCAPD3P42695 1498 aa40.13■■■■■ 4.02
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CCDC74B-205ENST00000409943 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.82■■■■□ 3.97
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CCDC74B-205ENST00000409943 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.25■■■■□ 3.87
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CCDC74B-205ENST00000409943 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.96■■■■□ 3.83
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CCDC74B-205ENST00000409943 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.6■■■■□ 3.77
CCDC74B-205ENST00000409943 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.6■■■■□ 3.77
CCDC74B-205ENST00000409943 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.56■■■■□ 3.76
CCDC74B-205ENST00000409943 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.48■■■■□ 3.75
CCDC74B-205ENST00000409943 WDR62O43379 1518 aa38.47■■■■□ 3.75
CCDC74B-205ENST00000409943 PRDM2Q13029 1718 aa38.46■■■■□ 3.75
CCDC74B-205ENST00000409943 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.33■■■■□ 3.73
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CCDC74B-205ENST00000409943 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.85■■■■□ 3.65
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CCDC74B-205ENST00000409943 CUX1P39880 1505 aa37.41■■■■□ 3.58
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CCDC74B-205ENST00000409943 CHD1O14646 1710 aa37.13■■■■□ 3.53
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CCDC74B-205ENST00000409943 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.04■■■■□ 3.52
CCDC74B-205ENST00000409943 TOP2BQ02880 1626 aa37.03■■■■□ 3.52
CCDC74B-205ENST00000409943 TRIM41Q8WV44 630 aa37.02■■■■□ 3.52
CCDC74B-205ENST00000409943 GRIN2BQ13224 1484 aa37.01■■■■□ 3.52
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CCDC74B-205ENST00000409943 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.99■■■■□ 3.51
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CCDC74B-205ENST00000409943 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
CCDC74B-205ENST00000409943 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.87■■■■□ 3.49
CCDC74B-205ENST00000409943 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.87■■■■□ 3.49
CCDC74B-205ENST00000409943 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.87■■■■□ 3.49
CCDC74B-205ENST00000409943 SYNJ2O15056 1496 aa36.83■■■■□ 3.49
CCDC74B-205ENST00000409943 ARHGEF11O15085 1522 aa36.8■■■■□ 3.48
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CCDC74B-205ENST00000409943 CEP170Q5SW79 1584 aa36.34■■■■□ 3.41
CCDC74B-205ENST00000409943 NUP160Q12769 1436 aa36.34■■■■□ 3.41
CCDC74B-205ENST00000409943 CUL7Q14999 1698 aa36.23■■■■□ 3.39
CCDC74B-205ENST00000409943 SHROOM2Q13796 1616 aa36.14■■■■□ 3.38
CCDC74B-205ENST00000409943 IGF1RP08069 1367 aa36.13■■■■□ 3.37
CCDC74B-205ENST00000409943 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.08■■■■□ 3.37
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CCDC74B-205ENST00000409943 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
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