Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX2Q99697 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms