Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRIM25Q14258 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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