Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX1P83916 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CBX1P83916 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CBX1P83916 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX1P83916 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX1P83916 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX1P83916 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX1P83916 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX1P83916 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX1P83916 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX1P83916 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX1P83916 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX1P83916 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX1P83916 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX1P83916 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX1P83916 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX1P83916 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX1P83916 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX1P83916 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX1P83916 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX1P83916 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX1P83916 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX1P83916 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX1P83916 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX1P83916 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX1P83916 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX1P83916 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX1P83916 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX1P83916 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX1P83916 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX1P83916 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms